引起本病的原因非常复杂，与个人因素遗传素质、免疫状态、精神心理状态、内分泌和健康状态等主观因素外，还与变应原、病毒感染、职业因素、气候、药物、运动和饮食等环境因素有关。
引起儿童咳嗽变异型哮喘的两大病因，一是先天性特异性过敏体质;二是环境影响。
气候诱因
冷空气、空气湿度的变化、气压的高低均可诱发过敏性咳嗽的发作。在温差变化大、湿度大或气压低的地区，过敏性咳嗽的发病率明显增高，当这些地区的过敏性咳嗽患者去气候干燥、气压较高的地区后，过敏性咳嗽情往往可以得到缓解。冷空气诱发过敏性咳嗽的机理是冷空气可以导致气道内热损失，致使肥大细胞释放介质，直接或间接诱发气道炎症，引起过敏性咳嗽发作，温度太高或太低均是过敏性咳嗽的不利因素。
根据过敏性咳嗽患者经常感觉自己的症状在雷雨天气时加重的现象，Robert等对雷雨天气发生的情况和儿童因过敏性咳嗽而急诊入院的情况进行的六年调查结果，结果证实了确实存在“雷雨过敏性咳嗽”的情况。发现在雷雨天气下，儿童因过敏性咳嗽而住院治疗的可能性增加了15%。曾有研究认为空气中花粉浓度的增加是导致“雷雨过敏性咳嗽”的原因，但Robert研究证实“雷雨过敏性咳嗽”的发生与雷雨天气的空气中真菌孢子浓度增加有关，而与空气中花粉浓度的变化无关。在雷雨天气下，空气中真菌孢子的浓度增加接近一倍。
运动过度和换气过度
运动诱发过敏性咳嗽的例子在临床上很常见，对于大多数过敏性咳嗽患者来讲，运动只是诱发因素，而对于运动性过敏性咳嗽患者，运动则可能是致病因素。实际上所有过敏性咳嗽患者和部分变应性鼻炎病人，在经过一定量的运动后均可出现喘息症状。其机制与运动过度所导致的过度换气，使气道热损失过多，气道内环境变冷从而诱导肥大细胞释放炎性介质并导致气道炎症有关。过敏性咳嗽患儿的大笑、大哭大闹导致的换气过度也经常诱发喘息症状。
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