根据病史、临床表现，结合试验室检查及影像学检查可确定诊断。
1.实验室检查
血液中白细胞计数和中性粒细胞升高，血培养可呈阳性。早期尿中无白细胞，当感染扩展到肾盂时，尿中可发现白细胞。尿培养的结果应与血培养相同。B超引导下穿刺抽脓培养可发现致病菌。
2.影像学检查 根据病变程度而有不同的表现。
(1)急性局灶性细菌性肾炎
腹平片：常无明显异常。静脉尿路造影对诊断有一定帮助，少数病人可出现肾盂肾盏受压。
B超检查：示肾实质局灶性低回声区，边界不清。
CT检查：为低密度实质性肿块。增强后密度不均匀增强，仍低于正常肾组织，肿块边界不清，不同于肾皮质脓肿。有文献报道CT示肾实质局限性肿大，并有多个层面，肾筋膜增厚是该病定性诊断依据。
(2)肾皮质脓肿
腹部平片：显示患侧肾脏增大，肾周围水肿使肾影模糊，腰大肌阴影不清楚或消失。当脓肿破裂到肾周围时，腰椎侧弯。静脉尿路造影可显示肾盂肾盏受压变形。
B超：显示不规则的脓肿轮廓，脓肿为低回声区，或混合回声区，肾窦回声偏移，稍向肾边缘凸出。
CT：肾扫描显示肾皮质不规则低密度病灶，CT值介于囊肿和肿瘤之间，增强CT扫描边缘增强明显，中心部无增强。肾被膜、肾周筋膜增厚，与邻近组织界面消失。放射性核素肾扫描：显示肾占位病变，肾缺损区与肾囊肿相似，用67Ga可提示感染组织。
鉴别
1、急性肾盂肾炎 主要表现为突发性的畏寒、高热，常伴有尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状。也会出现腰痛和肾区叩击痛。但尿路刺激症状更严重，而肾区叩痛较轻。B超检查肾无液性暗区，静脉泌尿系统造影(IVU)无肾盏受压变形移位性变化。CT亦无肿块。
2、肾周围炎和肾周围脓肿 主要表现为畏寒、发热、腰痛。但患者有腰椎向患侧弯曲，肢体活动受限。且KUB平片显示肾区密度增加，腰大肌阴影消失。B超和CT则可以鉴别是肾皮质还是肾周围的化脓性感染。
3、肾结核 其主要表现为尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状，伴有低热、盗汗、乏力、贫血等全身性结核中毒症状及不同程度的脓尿。但肾结核患者多无高热，而尿频较为严重，24 h尿中可查到抗酸杆菌，早期肾结核IVU表现为肾盏边缘不整齐，如虫蚀状;后期呈缺少1个或几个肾盏的征象。结核性脓肾时尿呈米汤样混浊，伴低热;B超可见肾内有积液。
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