甲状腺癌不是遗传病，但是具备遗传倾向。遗传倾向即有遗传的可能性，父母遗传给下一代的不是疾病的本身，而是遗传容易发生甲状腺癌的体质，即遗传易感性。遗传是发病的一个重要重要原因，但不是因素。具体病因如下：
甲状腺癌与家族性结肠息肉病（如Gardner综合征），包括结肠腺瘤性息肉合并软组织，以纤维瘤病最为多，合并纤维肉瘤，是常染色体显性遗传病，由位于染色体5q21～q22的APC基因突变所致，后者是参与细胞增殖调控的信号蛋白，在TSH刺激下，少数人可发生癌变，甲状腺癌。高碘饮食可能增加甲状腺乳头状癌的发生率。TSH大量分泌也能促发甲状腺细胞癌变。长时间服用生甲状腺肿物质可诱导出甲状腺癌，也可阻碍甲状腺激素的合成，使TSH分泌增多，刺激甲状腺滤泡增生，可能产生甲状腺的新生物，并伴有甲状腺的弥漫性肿大，而引起甲状腺肿瘤。
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