发病初期先有发热、无力，随后体温增高，并伴有恶心呕吐、意识障碍、神志不清甚至昏迷等精神症状。精神症状的轻重、病程长短依原发病而改变。一般讲，随躯体症状恢复而日趋好转，少数可持续1～2年;或随疾病后遗症出现而呈慢性期精神症状表现。部分患者还常留下严重的后遗症，如痴呆、精神失常、肢体残疾和癫痫等，病情严重者甚至导致死亡。
1.早期或急性期症状：
1.1.行为障碍：常有违拗症、刻板言语及刻板动作、模仿言语及模仿动作、蜡样屈曲等症状。多表现非对称的不自然姿势，安静时不随意运动消失，一旦精神紧张就出现。癫痫大发作或杰克逊癫痫，此时病人可伴有癫痫性格。
1.2.轻度意识障碍：可见各种不同程度(由混浊到昏迷)的意识障碍，如倦怠、嗜睡等。此时定向力不完整。可有运动性兴奋等。可遗留有迟钝、流涎或表现单纯性意识障碍。
1.3.幻觉妄想状态：病人呈无欲无力状态，思维迟钝或不连贯，表情呆板，动作少而慢。妄想多在幻觉基础上产生，以成年人多见，而且多在轻度意识障碍时出现。
1.4.感知综合障碍：有些病人有明显的视物显大、视物显小、视物变形以及体形感知综合障碍。所有这些也是多在意识障碍的基础上产生的。
1.5.言语障碍：表现为不会说话、口吃或拼音不清楚等。一般6个月恢复，少数可持续较长时间。
1.6.其他：少数病人可出现脑衰弱综合征。以及失眠、健忘、表情呆板、情感迟钝或易激惹、注意力涣散等症状。
2.后期或慢性期精神症状：
2.1.行为异常较明显：在儿童中多见，表现好动、冲动、喜恶作剧、破坏行为及手足徐动、痉挛性瘫痪等。
2.2.人格意志意向改变：病人变得幼稚、易冲动、好攻击人、报复他人、情绪不稳或缺乏克制能力。有的缺乏主动性及应有的情感反应，意志意向活动减弱，孤僻、死板。有的病人变得自私，易记仇。也有的病人表现为行为轻率，变得举止轻浮，性的意向增强，偷窃、说谎等。成年人多见。
2.3.智能障碍：常是精神发育迟滞的主要原因。在发病初期病情严重儿童多见，出现痴呆程度较重且恢复较差。张口反射、强握反射等原始动作也常见。
3.并发病症：因患者神志不清，呼吸道分泌物不易咳出，导致支气管肺炎和肺不张等肺部感染。其次褥疮、皮肤脓疖、口腔感染和败血症等。
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