本病的预后与患者自身条件与病因关系密切。若患者基础疾病重，起病急、症状重，出现全身多器官功能障碍，可能导致迅速死亡，若患者基础疾病较轻，并且经过及时抢救，预后好。若患者为青年人，无基础疾病，如因肺炎链球菌感染引起的急性重症肺炎，经过合理及时的治疗，患者基本上不遗留后遗症，可基本治愈。若患者为急性呼吸窘迫综合征（ARDS），该病死率高达26%~44%，继发于感染和免疫功能低下及老年患者并发条件致病菌感染的重症肺炎预后更差，但肺部创伤导致的ARDS一般预后较好。后遗症慢性呼吸衰竭反复发作，长期缺氧可导致肺气肿、肺间质纤维化、心肌损伤、心肌硬化等。因呼吸衰竭常需有创机械通气，气管插管时动作粗暴可导致牙齿脱落或导致下颌关节脱位。气管插管可引起喉头水肿，气囊压迫可导致气管-食管瘘。机械通气相关的其他并发症也可导致一定程度的相应后遗症。
并发症
心脏病变和心力衰竭因慢性缺氧导致肺血管收缩及支气管管腔狭窄等导致肺动脉高压，从而出现右心室肥厚，当随着疾病进展，肺动脉压力持续升高，超过右心室代偿能力，右心排出量下降，出现右心室扩大、右心衰竭，表现为明显气促、心悸、腹胀、下肢水肿。电解质酸碱平衡紊乱呼吸功能障碍出现的呼吸性酸中毒，早期出现血压增高、中枢神经受累，表现为躁动不安、嗜睡、精神错乱等，若快速改善通气，症状缓解较快。若持续缺氧或严重缺氧，可出现代谢性酸中毒，出现意识障碍、血压下降、心律失常甚至心跳骤停，危及生命。肺性脑病当慢性呼吸衰竭CO2潴留严重时，可出现肺性脑病，表现为神志淡漠、肌肉震颤、间歇抽搐、昏睡甚至昏迷。应用呼吸机辅助治疗改善通气后，患者肺性脑病可逐渐恢复。心功能衰竭严重的缺氧和CO2潴留可直接抑制心血管中枢，造成心脏功能抑制和血管扩张，导致血压下降、心律失常，甚至心室颤动、心脏骤停，严重危害生命。
肾功能不全呼吸衰竭患者缺氧常导致肾功能不全，及时治疗，肾功能可以恢复。消化系统功能障碍缺氧导致胃肠功能紊乱，表现为消化不良、食欲缺乏，甚至黏膜糜烂、出血、坏死。若缺氧即使纠正，消化功能障碍基本能恢复。
呼吸衰竭该如何预防呢？
积极治疗和控制原发基础疾病，解除支气管痉挛，减少支气管分泌物，降低气道阻力，减少能量消耗。改善机体的营养状况，坚持力所能及的锻炼，每天作呼吸操，增强呼吸肌的活动功能。对于年老、有慢性阻塞性肺疾病等抵抗力差的患者，可以定期注射肺炎球菌等疫苗，预防感染发生。
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