以下症状反复发作、持续不缓解影响生活质量时，应及时就医：上腹烧灼感、疼痛不适；腹痛加重，持续不缓解；严重腹泻或便秘，便血或黑便。诊断流程医生根据患者的胃肠道不适症状，并通过体格检查、化验和影像学检查排除了胃肠道的器质性病变后，可以诊断不同类型的功能性胃肠病。
就诊时医生可能会问如下问题：症状最早什么时候出现？有无明显诱因？与饮食或情绪有关吗？腹痛的部位，腹痛与吃饭或排便是否有关联；腹泻的次数是否做过检查，有无阳性结果？是否有正在服用的药物？就诊科室消化内科。
相关检查
医生查体：以腹部查体为主，主要包括：视诊、触诊、叩诊、听诊，可初步判断胃肠功能，并排除明显的器质性病变。
实验室检查：血常规：通过红细胞计数、血红蛋白含量明确是否存在贫血，通过白细胞计数及不同种类白细胞的比例判断是否有感染。肝肾功能、电解质明确是否存在肝肾等脏器功能异常，电解质紊乱。粪便常规+潜血：明确是否存在寄生虫、细菌等感染，是否有消化道出血。13C呼气试验：明确是否存在幽门螺旋杆菌感染。
影像学检查：钡剂灌肠造影：可以初步检查胃肠道黏膜病变，必要时还可以进一步的胃肠镜检查。胃肠镜、胶囊内镜：用于排除消化道溃疡、出血、肿瘤等器质性病变。排粪造影：是通过肛门向直肠内注入钡剂，在X线下动态观察大便从肛门和直肠通过的检查，除了可以明确直肠、肛门的解剖学异常，还能评估盆底肌的运动。
特殊检查：除了上述检查，医生还可能通过直肠肌电图、胃肠通过试验、结肠压力监测、肛门直肠测压等检查明确胃肠道、盆底肌的功能，查找便秘的原因。
鉴别诊断
医生将从多个方面进行详细检查进行鉴别判断。胃癌内镜活组织病理检查，怀疑恶性溃疡者，多处内镜下活检，阴性者短期内复查内镜并再次活检。消化性溃疡好发于胃和十二指肠，多数表现为中上腹反复发作性节律性疼痛，少数患者无症状，或以出血穿孔等并发症发生作为首次症状。慢性胆囊炎和胆石症疼痛与进食油腻有关，常位于右上腹、并放射至背部、对伴发热、黄疸的典型病例易作出鉴别，对不典型患者，则需借助腹部超声。克罗恩病部分患者可表现为腹痛和呕吐等症状，内镜下表现为结肠深溃疡，周围充血、结节样隆起或狭窄。鉴别借助于肠镜和病理检查。
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