1.诊断：
1.1.接触史：包虫病流行于畜牧业发达地区，牧民饲养犬羊并与犬羊密切接触可受染。畜牧业发达地区城镇居民也可因误食污染的畜产品而受感染。
1.2.症状：包虫感染初期，因为包虫呈扩张性生长，不侵犯临近组织，所以病人无明显自觉症状，往往无意中摸到局部无痛性包块始发现患病。当包虫体积逐渐增大，出现局部脏器的受压症状时，患者可觉隐痛，坠胀不适。合并继发感染者，出现脓肿的相应症状。并发包囊破裂者，根据其破裂程度及破入不同的腔道而产生相应的症状。
1.3.体格检查：触诊是包虫病的主要诊断方法，由于包囊外膜肥厚坚韧，又为囊液胀满，故局部触诊包虫的典型体征为表面光滑，边界清楚的无痛性肿块，且肿块触之硬韧，压之有弹性，扣之有震颤感即“包虫囊震颤征”(Hydatid thrill)。巨大肾包虫可于腰腹部扪及肿块，并可随呼吸运动而上下移动。睾丸或精索包虫可出现局部球形肿块，生长缓慢，透光试验阳性。
1.4.X线检查
肾包虫病在X线检查中主要表现为占位性病变的征象。平片上可见增大的肾脏及突出的包虫囊壁弧形阴影，囊壁钙化时，可见环状、线状致密影。如果子囊也钙化，可见大环状、线状致密影内或其临近有小的环状、线状致密影。包囊可压迫膈肌上抬，限制呼吸运动。逆行肾盂造影可见肾盂、肾盏挤压变形向内侧移位。肾盏变细延长，盏间距离增大、分离，出现“手握球征”。分泌性静脉尿路造影因肾实质长期受压萎缩，肾功能减退或丧失而显影不佳。
当包虫破入肾盏时逆行造影可见造影剂充盈肾盏并漏入包虫囊内，此时包虫体积因囊液外溢而明显缩小，囊内的多数子囊可呈葡萄样充盈缺损。若患侧输尿管内存留予囊，则显/扩张的输尿管中有蜂窝状的充盈缺损。透视下可见造影剂沿子囊间隙断续下滴，形成特有的“落雨征”。
1.5.B超检查：B型超声检查显示类圆形无回声反射的液性暗区及边界清楚的粗糙囊壁，较大的包虫并可见“双壁征”，系外囊与内囊界面间隙的征象，包虫后壁呈明显增强效应。含子囊的包虫可见花瓣状分隔或蜂窝形光带，探头挤压震动时可见原头节漂游的光点。超声波检查具有定位、定性、定量的诊断意义。
1.6.CT检查：CT为该病较好的影像学诊断方法，可显示完整的肥厚囊壁，边界清晰，囊液似水，密度均匀。含子囊时，由于子囊囊液密度低于母囊囊液，故在母囊内显出多个小囊，呈“囊中囊征”，子囊少时，靠近母囊壁排列，子囊多时呈葡萄状圆形阴影，若子囊过多，填满母囊，则众多子囊相互靠近，由球形挤压成方形或菱形，在断层切面扫描显示车轮形或蜂窝状的排列分隔，为本病的特有影像。
1.7.实验室检查：血常规检查白细胞分类示嗜酸性粒细胞计数增高，合并感染或手术后可有一过性地明显升高。当包虫破入泌尿道可在尿液中见到白色粉皮样碎片，镜下检到原头节或头钩。皮内试验在单纯性病例，即刻反应和延迟反应均呈阳性，阳性率在80%～90%之间。
1.8.免疫学检查
1.8.1.皮内过敏试验(Casoni试验)：采用经过处理的灭菌人或羊包虫囊液作为皮试抗原，稀释成1%作皮内注射形成0.5cm皮丘，另作生理盐水皮丘作为对照。15分钟后若对照皮丘消失，试验皮丘扩大或红晕直径大于1cm则为阳性结果，如果皮丘水肿大于1cm或红晕大于2cm则为强阳性结果。如在注射6～24小时后始出现阳性反应则称为迟缓反应，仍有诊断意义。
1.8.2.间接红细胞凝集试验(IHA)：其敏感性与特异性均较强，阳性率可达76%～82%且罕有假阳性反应，与皮内过敏试验协同可用于临床及流行病调查。
1.8.3.酶联免疫吸附试验(ELISA)：阳性率可达80%～96%，其敏感性强，特异性高，简便易行。
1.8.4.亲和素-生物素.酶聚合物酶联免疫吸附试验(ABC-ELISA)：本方法更为灵敏，且假阳性率极低。
1.8.5.斑点酶联免疫吸附试验(DOT-ELISA)：该试验特异性强，可以目测结果，适于基层推行。
1.8.6.其他：如固相金银免疫法、LAT试验、IFA试验等等。
2.鉴别诊断：细粒棘球蚴病需与先天性肝囊肿、胆管囊肿、肝血管瘤等相鉴别。还需与以下疾病相鉴别。
2.1.肾包虫与肾癌的鉴别：肾包虫主要发病于包虫病流行区，并有包虫的接触史，Casoni皮内试验阳性，B超可显示肿块内有无回声的液性暗区。肾癌体检可扪及腰腹部坚硬的肿块，而无肾包虫的震颤征，B超检查为不均匀实质性肿块，CT可进一步明确诊断。
2.2.肾包虫与肾囊肿及肾良性占位病变的鉴别：三者均可产生占位效应，压迫肾脏导致肾功能减退，根据其病史、血清免疫反应及B超、X线、CT等影像学检查可予以区别。
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