庚型肝炎病毒在肝炎的病原学诊断过程中发现，有不少输血后或散发性肝炎病例不能用现有的检测方法检出其病毒学标记，提示在已经认识的五种肝炎病毒之外，还存在其他未被发现的病原体。早在1967年，美国Deinhardt等从1例患急性黄疸型肝炎的外科医生在出现黄疸后第三日采取的血液接种到狨猴身上引起非甲乙丙型肝炎，以庚型肝炎病毒患者姓名的个字母命名为GB病毒。1993年Lisiysyn等将储存的含(出病毒的血清接种到绢毛猴(tamarin)体内，从被感染猴血清中进行克隆和序列分析，发现两种非甲乙丙丁戊型肝炎RNA病毒，基因长度约8.3kb以上，命名为GBV-A和GBV-B。后来又从该血清中分离出第三种病毒，称为GVB—C。
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