1.实验室检查：
1.1.电镜检查 HPV是最早在电镜下观察到的病毒之一，将活检标本负染，若能在电镜下见到特征性的病毒颗粒，即叮作出诊断，而用免疫电镜可提高检出率。电镜检查法虽然准确率很高，但费时，需特殊仪器设备，且检出阳性率很低。
1.2.PCR技术 应用此法可检测HPV—DNA及差因分型，灵敏度可达lfg。该法操作简便省时，而且标本来源不受限制，如病变组织或脱落细胞、分泌物或黏液、新鲜标本或保存已久的石蜡切片等标本均可。
1.3.血清学检查
目前尚不能用血清学方法对HPV进行确诊及分型。现正在研究试用基因工程表选产生的晚期蛋白来检测患者血清中相应的抗体。初步认为，L1和L2蛋白可用于检测HPV型特异性免疫应答。
1.4.核酸杂交技术 核酸分子杂交技术不仅能对HPV进行确诊，而且还能对HPV进行讣型。利用放射性核素或生物标记的HPV-DNA探针来检测患者标本中是否存在互补的核酸链。最常用的方法为斑点杂交法，其次为southem印迹及原位杂交。
1.5.内镜检查 要发现阴道、肛门及直肠、尿道等部位的生殖器疣则分别需借助阴道镜、肠镜以及尿道镜等内镜检查，凭外观特征进行诊断。
2.诊断和鉴别诊断：
2.l.诊断
2.1.1流行病学资料：有直接或间接接触HPV感染着或被HPV污染物品史。
2.1.2.临床表现：根据各种疣的肉眼外观、发病部位及发展情况诊断并不难。如通过肉眼观察即可诊断各种皮肤疣和生殖器疣，因具有一种外突的特殊表现。然而，大量人群体检发现，肉眼观察的生殖道病损与组织学检查结果约有10%不相符，需进一步检查确诊。
2.1.3.辅助检查
2.1.3.1.核酸分子杂交检测HPV—DNA及血清学方法检测HPV抗原。
2.1.3.2.组织病理学检查：可取好发部位刮片、分泌物涂片、病变部位活楦.根据特征性的组织学和组织病理损伤作出诊断。
2.2.鉴别诊断应与下列痰病相鉴别：
2.2.1.疣状皮肤结核：需与寻常疣相鉴别，但它为不规则的疣状斑块，周围有红晕，常伴有结核中毒症状。
2.2.2.鸡眼：需与跖疣鉴别，其压痛明显，表面平滑。
2.2.3.毛囊上皮瘤及汗管瘤：有时需与扁平疣相鉴别。此两者好发于眼附近，组织学改变完全不同。
2.2.4.乳头状瘤：较尖锐湿疣大。有的直径可达4～5cm，病程慢，常无症状，多发生在老午妇女，需送病理检查确诊。
2.2.5.二期梅毒扁平疣：多为单发，边缘清楚、整齐.基底平坦清洁，质硬而不痛的硬性下疳。梅毒血清反应可作为诊断依据。
2.2.6.生殖器鳞状细胞癌：多见于40岁以上的人，无不洁性交史，浸润损害明显，常形成溃疡，组织病理检查可以确诊。
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