Prader-Willi综合征不会遗传。疾病可分为遗传病和非遗传病两大类。遗传病是指完全或部分由遗传因素决定的疾病，常为先天性的，也可后天发病。由感染或伤害引起的则是非遗传病。Prader-Willi综合征属于非遗传性疾病，病因如下：
可能是下丘脑功能障碍。刺激实验动物下丘脑的某些部位可产生类似表现，在人类尚缺乏病理学支持。病理仅见睾丸间质细胞减少。半数以上患者有15qll-13缺失，且均来自父亲。少数有家族性矮胖和糖尿病史，还有家族性染色体倒位畸变。
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