结核杆菌感染尿道时，先于粘膜上形成结核结节，结节扩大融合形成溃疡，溃疡基底部由肉芽组织组成，肉芽组织纤维化形成尿道狭窄。阴茎结核，若直接接触引起，病变多发生在阴茎头、阴茎系带或尿道外口，尿道、阴茎结核的病因最初为结核结节，而后溃疡，其基底部有干酪样坏死或肉芽组织;若由血行感染引起，则在阴茎海绵体结节，纤维化可使阴茎弯曲。
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