卵巢分泌的雌激素使子宫内膜增生，月经中期卵巢排卵后产生黄体，这黄体既能分泌雌激素又分泌孕激素，使子宫内膜在增生的基础上变成分泌期内膜。如果这个月排出的卵子没有受精，则黄体在排卵后9～10天开始萎缩，血供减少，激素分泌下降，约5～7天后即月经周期的第28天左右，子宫内膜不能维持而逐步脱落出血形成月经。
如果黄体功能不健全，则孕激素分泌不足，子宫内膜不能产生正常的分泌反应或各部分内膜反应不一致，势必影响月经，这两种黄体功能不正常的月经不调都是有排卵的，故医学上称为有排卵型子宫功能失调性出血，多见于生育年龄妇女或流产后，足月分娩后。
目前认为黄体功能不足因多种因素所致，排卵性月经失调的病因是神经内分泌调节功能紊乱，可导致卵泡期FSH缺乏，使卵泡发育缓慢，雌激素分泌减少;LH脉冲频率虽增加，但峰值不高，LH不足使排卵后黄体发育不全，孕激素分泌减少;FSH/LH比率异常也可造成性腺轴功能紊乱，使卵泡发育不良，排卵后黄体发育不全，以致子宫内膜分泌反应不足。有时黄体分泌功能正常，但维持时间短。部分患者在黄体功能不足的同时，表现为血催乳激素水平增高。此外，排卵性月经失调的病因如初潮、分娩后及绝经前，也可能出现下丘脑-垂体-卵巢轴功能紊乱，导致黄体功能不足的发生。
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