1.诊断检查：
1.1.实验室检查：胆汁中胰酶浓度增高，开腹手术或经皮经肝采集的胆管或胆囊内胆汁中胰酶浓度增高。症状发作时胆汁中各种胰酶尤其淀粉酶总活性明显升高，常大于1000U，直接反映了胆汁中有胰液反流。此外，用电泳法检测血清淀粉酶同工酶谱，发现胆管扩张患者血清淀粉酶出现老化现象，明显区别于正常人及急性胰腺炎患者，提示了APBDU的存在。
1.2.影像学检查：
1.2.1.B超、CT检查：B超、CT仅能提供一些间接征象，尚不能作为首选检查方法。
1.2.2.PTC、ERCP及MRCP检查：通过内镜逆行胰胆管造影、经皮肝穿刺胆道造影和术中胆道造影、磁共振胰胆管显影(magnetic resonance cholangio-pancreatography，MRCP)等方法，若观察到胆管和胰管存在以下情况即支持诊断：具有异常长的胆胰管合流的共同通道，胰胆管合流形态异常。在上述检查方法中，ERCP可清晰显示胆管和胰管的解剖位置、共同管长度、直径及胰管的形态等，对胰胆管合流异常提供客观的依据，可作为诊断APBDU的首选检查方法。HASTE-MRCP对胆管扩张和狭窄的检出率近100%，但对于小儿的APBDU检出率略低，尤以伴胆管扩张者显示不甚满意。注射促胰液素刺激胰液外分泌后行动态MRCP检查，可观察APBDU患者胆管及胆囊的优先充盈，可提示胰液向胆管的反流。
2.诊断标准：
2.1.胆管与胰管于十二指肠壁外合流。
2.2.胰管与胆道合流的共同通道> 15mm。
2.3.胆汁中淀粉酶升高，大于1000U/L。
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