椎管内肠源性囊肿不会遗传。疾病可分为遗传病和非遗传病两大类。遗传病是指完全或部分由遗传因素决定的疾病，常为先天性的，也可后天发病。由感染或伤害引起的则是非遗传病。椎管内肠源性囊肿属于非遗传性疾病，病因如下：
这类囊肿又称原肠囊肿、神经肠囊肿，是在胚胎期中，因为未来将要发生成为食管和呼吸系统区的内胚层组织，向背侧穿过插在内胚层与中胚层之间的组织，到达神经板而逐渐在椎管内形成的囊肿。囊肿位于颈段、胸段或颈胸交界区域，在硬脊膜内髓外或髓内。约有半数病例在纵隔内尚有肠源性囊肿，但极少与椎管内者互相通连。囊壁具有无肌层的单纯或假性复层上皮，有的有肌层，其上皮则似来自食管、胃或肠道。
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