1.诊断：
1.1.B超检查：是一种首选、无创、价廉、敏感的检查方法，诊断囊肿的准确率可达95%，可明确囊肿的部位、大小、数目及与周围脏器的关系。
1.2.CT检查：可显示囊肿部位、大小及与周围脏器的解剖关系，及囊肿有无钙化影等征象。
1.3.经皮细针穿刺细胞学及囊液检查：常在B超或CT引导下作囊液穿刺，如囊液清亮，培养无细菌生长，囊液淀粉酶含量不高，常为真性囊肿;如囊液混浊，呈褐、绿色，培养细菌阳性，囊液中淀粉酶含量升高，则常为假性囊肿。
1.4.剖腹探查：剖腹行病理学检查是确诊最可靠方法。真性囊肿的囊壁薄而透明，与周围组织无粘连，囊液清亮，囊肿周围胰腺组织正常。假性囊肿的囊壁厚而不透明，与周围组织有粘连，囊液呈混浊，褐、绿色，囊肿周围的胰腺组织有炎性改变。显微镜下见真性囊肿的囊壁内衬上皮细胞，假性囊肿的囊壁内衬有胶原纤维组织组成的假膜。
根据临床表现，B超、CT检查，一般均可发现胰腺囊肿，如行手术病理检查即可确诊。
2.鉴别诊断：
2.1.肾盂积水：由于先天性肾盂与输尿管连接部的狭窄，肿瘤或结石造成尿液排出受阻，而积聚于肾盂内所致。巨大肾盂积水可在侧腹部扪及囊件肿块，伴腹部胀痛和腰痛，需与胰腺囊肿进行鉴别。行B超和静脉肾盂造影可以发现病变，必要时在B超引导下作肾盂造影可以确诊。
2.2.脾囊肿：很少见，巨大睥囊肿可有左上腹胀痛及扪及腹部包块，需与胰腺囊肿鉴别。但行B超和腹部CT即可区别囊肿的来源。
2.3.肾上腺囊肿：很少见，巨大肾上腺囊肿可产生侧腹部不同程度的胀痛，可扪及腹块，需与胰腺囊肿进行鉴别。但行B超和腹部CT检查可以区别，对鉴别有困难者，需剖腹探查才能确诊。
2.4.肝囊肿：多见，当肝囊肿位于肝下缘或体积较大时，上腹部可扪及包块，需与胰腺囊肿进行鉴别。一般通过B超和腹部CT可作出诊断。
2.5.肠系膜囊肿：罕见，常发生于小肠系膜，多为淋巴管囊肿，有时腹部扪及包块，需与胰腺囊肿进行鉴别.但行胃肠钡餐造影发现肠外占位，B超可发现囊性肿块，常需要通过手术探查方可最后确诊。
2.6.高位卵巢囊肿：较大的高位卵巢囊肿可产生腹胀及腹部扪及包块，需与胰腺囊肿鉴别。行B超、腹部CT检查可显示囊肿的来源及形态，妇科检查可触及肿块，有时可有血清CA125，AFP、HCG及雌激素水平的升高，可资区别。
2.7.腹膜后肿瘤：可来源于腹膜后脂肪组织、结缔组织、筋膜、肌肉、血管、神经及淋巴组织等，表现为腹胀痛，侧腹部囊性或坚硬的肿块，需与胰腺囊肿进行鉴别。一般行B超、腹部CT检查有很大帮助，怀疑为淋巴瘤时可以行淋巴管造影检查，腹膜后充气造影有帮助，于鉴别十分困难者可剖腹探查得到确诊。
2.8.胆总管囊肿：是少见先天性疾病，常在右上腹部扪及表面光滑、富有弹性、椭圆形的肿块，这时需与胰腺囊肿进行鉴别，但行B超、静脉胆道造影检查可获确诊。
2.9.胰腺癌：常有上腹饱胀、疼痛，疼痛向腰背部放射，可触及腹块，需与胰腺囊肿进行鉴别。但胰腺癌的腹块坚硬而固定，行B超，腹部Cr检查有很大帮助，肿瘤标志物CEA.CA199.POA常可阳性，于鉴别诊断有困难时，可B超或CT引导下细针穿刺行病理学检查，必要时剖腹探查可获确诊。
2.10.胃癌：晚期胃癌可扪及腹块，需与胰腺囊肿进行鉴别，但胃癌病人常有明显消瘦，常有恶心、呕吐，呕吐物呈咖啡残渣样，常有左锁骨上淋巴结转移，做纤维胃镜检查即可确诊。
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