预后
肠道病毒感染绝大多数病情较轻，一般都可顺利恢复。新生儿全身感染影响心、脑、肝等重要器官时，病情危重，预后差。急性中枢神经系统感染也很少发生瘫痪，轻瘫者恢复快，极少留下后遗症。大流行中个别病毒侵犯延髓、脑桥者，也可危及生命。急性心肌炎大都恢复，也可发生猝死，个别患者病程迁延或反复发作，可导致慢性心肌病。
预防
重视环境卫生和个人卫生，加强体格锻炼，均有助于防止本病的流行。对接触患者的婴幼儿，可注射丙种球蛋白或胎盘球蛋白以预防感染。也有广泛服用脊髓灰质炎减毒活疫苗，使产生肠道干扰作用而控制其他肠道病毒引起的无菌性脑膜炎的流行。这是一种非特异性的预防措施，值得进一步研究。由于柯萨奇病毒、埃可病毒及其他肠道病毒型别甚多，故制备型特异的疫苗有一定困难，目前尚不能普遍应用。
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