残窦综合征不会遗传。疾病可分为遗传病和非遗传病两大类。遗传病是指完全或部分由遗传因素决定的疾病，常为先天性的，也可后天发病。由感染或伤害引起的则是非遗传病。残窦综合征属于非遗传性疾病，病因如下：
由于残留胃窦的黏膜受到反流的碱性十二指肠液刺激而产生大量的胃泌素，经吸收进入血液，作用于胃底部黏膜，刺激残胃的壁细胞，促使胃液发泌过多，胃酸过高，发生术后吻合口溃疡。
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