鼻旁窦支气管综合征不是遗传病，但是小部分患者的发病可能与遗传有关。有家族史的家庭成员，发生的比率比没有家族史的要高些，说明鼻旁窦支气管综合征的发病与遗传有一定关系，但是无明确的对应关系。具体病因如下：
常由感染所致，可能为下行性感染(先感染鼻旁窦，后下行传入下呼吸道)或上行性感染(下呼吸道先感染，后波及上呼吸道)。也有人认为与遗传因素有关。
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