1.诊断：腹痛和腹部体征与AIDS病具有的机会致病菌感染的胃肠道表现相似，因此诊断较为困难。
基于对AIDS病人的误诊和误行手术将会给病人带来很大的危险，因此常常为明确诊断而延误治疗。诊断除根据临床症状与体征外，血细胞检查并不能给予有利的依据，B超检查和CT扫描常可给予帮助，恰当地使用腹腔镜确诊率很高，但只有必须之时才用。
2.鉴别诊断：在诊断中最为重要的是要与AIDS病本身所致的机会致病菌胃肠道感染相区别如巨细胞病毒性结肠炎急性盲肠炎等。
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