机会性致病菌往往也称做条件致病菌。它指的是正常菌群与宿主之间、正常菌群之间，通过营养竞争、代谢产物的相互制约等因素，维持着良好的生存平衡。但是一旦在一定条件下这种平衡关系被打破，那些原来不致病的正常菌群中的细菌就会有可能成为致病菌，人们一般习惯将这类细菌称为条件致病菌。
打破菌群之间平衡关系往往需要一定的条件，这种条件大概可以分为以下几类：由于菌群失调而引起的菌群失调症。由于机体免疫功能低下而常常引起的内源性感染。某些细菌寄居部位的改变，如某些大肠杆菌是肠道内的常见菌，而一旦它们进入泌尿道，就会引进机体的泌尿道感染;
此外，我们还需要了解的是那些能导致条件性致病的微生物，一般被称为条件性致病微生物。这类条件性致病微生物主要是细菌，如大肠杆菌，副猪嗜血杆菌等。
这类条件性致病微生物一般是指在正常情况下，寄生于机体的这类微生物并不发病，而一旦机体抵抗力下降时，此时原寄生部位中的微生物繁殖加快，使微生物在数量上发生了变化，导致局部微生物菌群的失调最终导致了发病。 如大肠杆菌一般是寄生于大肠中的正常菌群，当人体的抵抗力一旦下降时，大肠杆菌就可以在肠道大量繁殖，引起肠道细菌去失调，进而导致肠道疾病的发生。
更严重的是，在机体抵抗力下降时，大肠杆菌又可转移到肝脏、心包、气囊、腹膜、呼吸道等，导致全身发病。
由此看来，其导致机体发病主要有两种情况，一是正常寄生部位的微生物大量繁殖，导致局部环境失衡。二是寄居部位发生改变，引起异常侵害。
