一般对功能亢进者采用：①手术切除导致功能亢进的肿瘤或增生组织;②放射治疗毁坏肿瘤或增生组织，减少激素的分泌;③药物治疗，抑制激素的合成和释放，如奥曲肽抑制多种激素(GH、PRL、胰岛素等)的分泌;溴隐亭抑制PRL、GH的分泌并有缩小肿瘤的作用;赛庚啶和酮康唑治疗库欣综合征。咪唑类和硫脲类药物抑制甲状腺碘的氧化和有机结合，减少甲状腺激素的合成，治疗Graves病。米非司酮(mlfepristone，RU486)可以阻断糖皮质激素受体，缓解库欣综合征患者的症状;肾上腺素能受体阻断剂普萘洛尔可以缓解甲状腺激素过多引起的肾上腺素能受体活性增强，酚妥拉明和酚苄明可选择性阻断。肾上腺素能受体，从而缓解嗜铬细胞瘤分泌过多去甲肾上腺素所致高血压等。采用化疗治疗恶性内分泌肿瘤从而缓解症状亦是可取的，如双氯苯二氯乙烷(米托坦)治疗肾上腺皮质癌。三种主要治疗可以相互配合以提高疗效。
对于功能减退类，主要采用：①有关缺乏激素的替代治疗(replacement therapy)或补充治疗(substitut10n therapy)，如甲状腺功能减退者补充甲状腺激素(左甲状腺素、干甲状腺);肾上腺皮质功能减退者补充皮质醇(氢化可的松);男性性腺功能减退者补充睾酮类制剂;甲状旁腺功能减退者主要补充钙与维生素D;垂体性侏儒症患者则补充人生长激素制剂。②内分泌腺组织移植，提供身体的需要，如胰岛细胞或胰腺移植、甲状旁腺组织移植等。
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