蛋白质丢失性胃肠病的发病机制主要有三：
1.胃肠黏膜糜烂或溃疡导致蛋白渗出或漏出。
2.黏膜细胞损伤或缺失，细胞间紧密连接增宽，导致黏膜通透性增加，血浆蛋白漏入肠腔。
3.肠淋巴管阻塞，肠间质压力升高，使富含蛋白质的肠间质不但不能保持在间质中或被吸收入血循环，反而使其溢出，进入肠腔而丢失。
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