恐怖症的原因目前尚不十分清晰，目前研究与遗传、生化和特殊的条件反射相关。
1.广场恐怖症
是恐怖症中最常见的一种，其病因可能为：广场恐怖症常以自发性惊恐发作开始，然后产生预期焦虑和回避行为;提示条件化的形成。一些临床研究表明，广场恐怖症患者常同时有惊恐发作。
2.社交恐惧症
社交恐怖症发病原因不详，是以害怕与人交往或当众说话，担心在别人面前出丑或处于难堪的境况，因而尽力回避为特征的一种恐怖障碍。
3.物体恐怖症
又称单纯恐怖症或称单一恐怖症、特殊恐怖症。其病因是由于某些无害的事物或情境与令人害怕的刺激多次重叠出现，形成条件反射，因而获得了引起焦虑的性质，成为患者恐怖的对象。这种焦虑是一种不愉快的情感体验，促使患者采取某种行为去回避它。如果回避行为使患者的焦虑得到减轻或消除，便会成为一种强化因素，通过操作性条件反射，使这种行为本身固定下来，持续下去。
发病机制
1. 遗传因素
家系及双生子调查提示场所恐怖症可能与遗传有关。有调查显示，60例场所恐怖症先证者的同胞和双亲12.5%同患场所恐怖症13对单卵双生子中4对同病，而16对双卵双生子中无同病者。
2. 条件反射理论
恐怖症是因某些无害事物或情景与令人害怕的刺激多次同时出现，形成条件反射，成为患者的恐惧对象，并引起焦虑从而可促使患者采取某种行为加以回避如果回避行为使患者的焦虑减轻，成为一种强化因素，通过操作性条件反射，使这种行为固定下来。例如，场所恐怖症症状的反复出现使焦虑情绪条件化回避行为则阻碍了条件化的消退;加上害怕、昏倒和当众出丑会更加重焦恐怖症状形成并固定化。
3. 生化改变
社交恐怖症患者可有5-HT系统(可能与其情绪反应有关)及NE功能失调社交恐怖症患者恐惧时可以出现血浆肾上腺素浓度急剧升高，可能与患者的认知过程有关焦虑症的惊恐发作则无这种现象而静滴乳酸盐可引起焦虑症患者的惊恐发作，但不引起恐怖症患者发生惊恐提示两种障碍的生化机制不同。
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