碘缺乏病的临床表现取决于缺碘的程度，缺碘时机体所处发育时期，以及机体对缺碘的反应性或对缺碘的代偿适应能力，如碘缺乏发生在胚胎脑组织发育的关键时期(从妊娠开始至出生后2岁)，则主要影响智力发育，并有身体发育及性发育障碍，即为克汀病，如碘缺乏是在儿童期，即可发生甲状腺肿。
1.地方性甲状腺功能减退症：
可分为3型：神经型，黏液性水肿型，混合型，大多数患儿表现为混合型。
1.1.神经型：智力呈中度及重度减退，甲状腺轻度肿大，身高可正常，表情淡漠，聋哑，多有精神缺陷，眼多斜视，痉挛或瘫痪，膝关节屈曲，膝反射亢进，可出现病理反射，甲状腺功能正常或轻度低下。
1.2.黏液性水肿型：轻度智力低下，有的能说话，侏儒状态明显，生长发育和性发育落后，有甲状腺肿大和严重的甲状腺功能低下表现，有典型的面容，便秘及黏液性水肿较突出，某些病人呈家族性发病。
1.3.混合型：其临床表现两者均有，两种类型地方性甲状腺功能减退症的临床表现的比较。
2.甲状腺肿：
根据甲状腺肿中是否有结节，分为以下3型：
2.1.弥漫型：甲状腺均匀增大，摸不到结节。
2.2.结节型：在甲状腺上摸到一个或几个结节。
2.3.混合型：在弥漫肿大的甲状腺上，摸到一个或几个结节。
甲状腺如肿大明显，可压迫气管引起咳嗽和呼吸困难，压迫食管引起咽下困难，压迫喉返神经引起声音嘶哑，胸骨后甲状腺肿可使头部，颈部，上肢静脉回流受阻，表现为面部青紫，水肿。
3.亚临床患者：
3.1.类甲状腺功能减退症：除了明显的甲状腺功能减退症和地方性甲状腺肿外，还存在着许多亚临床患者，De Quarrain与Wegelin首先用类甲状腺功能减退症来描述亚临床患者，并做如下规定：如有可疑甲状腺功能低下，可疑智力低下或两者均有，只要有其中一项，则考虑为类甲状腺功能减退症。
3.2.亚临床体格发育落后综合征：主要是身高和体重低于正常儿童，某些生理检查指标如握力，肺活量和血压等也偏低，少数人还有轻度骨骺发育落后，性发育落后一般不明显。
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