先天性无阴道不会遗传。疾病可分为遗传病和非遗传病两大类。遗传病是指完全或部分由遗传因素决定的疾病，常为先天性的，也可后天发病。由感染或伤害引起的则是非遗传病。先天性无阴道属于非遗传性疾病，病因如下：
本病系胚胎在发育期间受到内在或外界因素阻扰，亦可能由于基因突变（可能有家庭史）引起副中肾管发育异常所致。以正常女性染色体核型，全身生长及女性第二性征发育正常，外阴正常，阴道缺失，子宫发育（仅有双角残余），输卵管细小，卵巢发育及功能正常。总体来说，病因有：染色体异常。雄激素不敏感综合征。母亲孕早期使用雄性激素、抗癌药物、反应停等。孕早期感染某些病毒或弓形虫。
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