诊断检查：
一、辅助检查
1.外周血白细胞计数正常或偏低，有时白细胞可以升高。
2.脑脊液检查脑脊液压力增高，外观多清亮，白细胞总数增加，多在300×10^6/L以下，以淋巴细胞为主。病毒性脑炎的检查下少数患儿脑脊液白细胞总数可正常。病毒性脑炎患儿脑脊液蛋白质大多轻度增高或正常，糖和氯化物无明显改变。涂片或细菌培养均阴性。
3.病毒病原学诊断
目前有关病毒性脑炎的病原学检查主要有：①病毒分离：对于不同的病毒可以从不同标本中进行病毒分离，提供病原学证据，具有病毒性脑炎的确诊价值。如脑脊液(肠道病毒、单纯疱疹病毒、腮腺炎病毒)、唾液、粪便(脊髓灰质炎病毒、轮状病毒)、尿、皮损等。②血清学检测：包括酶联免疫方法、免疫荧光法等，用于病毒鉴定、病毒抗原检测、特异性病毒抗体(IgM或IgG)检测。③分子生物学方法：常用的有聚合酶链反应(PCR)、实时PCR及生物芯片技术等，可从患儿脑组织和脑脊液中检出病毒DNA序列，从而确定病原。
4.脑电图
主要表现为高幅慢波，多呈弥漫性分布，可有痫样放电，对病毒性脑炎的诊断有参考价值。但脑电图表现无特异性，不能判断病原。脑电图正常不能完全排除脑炎。
5.影像学检查主要用于评估中枢神经系统受损的程度，MRI优于CT.在严重病例中，CT和MRI均可显示炎性病灶形成的大小不等、界限不清、不规则低密度或高密度影，轻症可无明显异常改变。
二、诊断
病毒性脑炎的诊断主要根据病史、临床表现、脑脊液检查和病原学鉴定。
鉴别诊断：
病毒性脑炎在临床上应注意和下列疾病进行鉴别：
1.化脓性脑膜炎
化脓性脑膜炎若未经过正规治疗时，其脑脊液改变可以与病毒性脑炎相似，应结合病史、治疗经过以及病原学检查进行鉴别。
2.结核性脑膜炎
婴幼儿结核性脑膜炎往往急性起病，且脑脊液细胞总数及分类与病毒性脑炎相似，需要进行鉴别。结核性脑膜炎可有结核接触史，脑脊液糖和氯化物均低，伴有其他部位的结核感染，结合结核菌纯蛋白衍生物(PPD)试验和血沉等，可以鉴别。
3.真菌性脑膜炎
起病往往较慢，病程长，颅内压增高明显，头痛剧烈，脑脊液墨汁染色可鉴别。
4.其他
须与颅内非炎症性疾病(脑血管疾病、肿瘤、变性病)及中毒性脑病、Reye综合征或脑脓肿相鉴别。
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