诊断检查：
1.血
血常规大多嗜酸性粒细胞增多，其他有缺铁性贫血、血浆门蛋白降低、血IgE增高，血沉中度增快。
2.粪便
粪便检查的主要意义在于除外肠道寄生虫感染。
3.X线检查
缺乏特异性。嗜酸细胞性胃肠炎的检查可完全正常。胃肠造影可见胃或(和)小肠粘膜皱襞增宽和结节样充盈缺损，食管受累有时可见食管狭窄类似于贲门失弛缓症。CT检查可能发现肠壁增厚，肠系膜淋巴结肿大或腹水。
4.内镜检查及活检
对以粘膜和粘膜下层受累为主的嗜酸细胞性胃肠炎有较大的价值。内镜下可见到粘膜皱襞出大、充血、溃疡或结节。粘膜活检从病理上证实有无嗜酸性粒细胞浸润。为提高诊断准确性，应在可疑病变部位正常和异常粘膜做多点活检。内镜检查及活检对以肌层或浆膜下浸润为主的病人嗜酸细胞性胃肠炎的诊断意义不大。
5.腹腔穿刺和腹腔镜
腹水病人行诊断性腹腔穿刺，腹水为渗出性，内含大量嗜酸性粒细胞。腹腔镜下缺乏特异表现，主要意义在于可进行腹膜活检，以期作出病理诊断。
诊断：
嗜酸细胞性胃肠炎的诊断须符合以下标准：①有消化道症状;②病理证实胃肠道一处或多处组织嗜酸性粒细胞浸润;③无胃肠道以外多器官嗜酸性粒细胞浸润;④无寄生虫感染。外周血嗜酸性粒细胞增多支持本病的诊断，但不作为诊断标准，因为部分病人外周血嗜酸性粒细胞可不增多。同样，食物过敏也不能作为嗜酸细胞性胃肠炎的诊断标准。
鉴别诊断：
诊断嗜酸细胞性胃肠炎时与以下疾病相鉴别：肠道寄生虫病，结缔组织系统疾病如血管炎、皮肌炎、硬皮病等，药物过敏，胃肠道内恶性淋巴瘤等。
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