炎症性肠病不是遗传病，但是具备遗传倾向。遗传倾向即有遗传的可能性，父母遗传给下一代的不是疾病的本身，而是遗传容易发生炎症性肠病的体质，即遗传易感性。遗传是发病的一个重要重要原因，但不是因素。具体病因如下：
炎症性肠病是由于病原体、毒素，某些药物等抗原引发物的启动下，激活消化道局部免疫细胞和体液免疫反应。它有两大类：局限性肠炎，由于某种病原体侵入肠上皮，尔后引起自身免疫反应所致；溃疡性结肠炎，病因尚未阐明，可能是遗传易感者，通过外源因素使肠黏膜损伤，导致免疫调节和反馈失常。
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