全身感染指的是在机体与病原菌的相互作用中，由于机体的免疫功能相对比较薄弱从而不能将病原菌限于机体局部，最终导致病原菌及其毒素向机体周围扩散，最终经淋巴道或直接侵入血流从而引起机体发生的感染。
在全身感染的过程中可能会出现下列几种情况：
(1)菌血症：由于病原菌自局部病灶不断地侵入人体血流中，但是病原菌由于受到体内细胞免疫和体液免疫的作用而不能在血流中进行大量生长繁殖。
(2)毒血症：这是病原菌在局部生长繁殖过程中，细菌虽然不侵入人体的血流但其产生的毒素可以进入血流从而引起的独特的中毒症状。
(3)败血症主要是在机体的防御功能犬为减弱的情况下，病原菌不断侵入血流并在血流中大量繁殖，由于释放大量毒素而造成机体的严重损害最终引起全身中毒的症状。
(4)脓毒血症是由于细菌随血流扩散，进而在全身多个器官引起多发性化脓病灶。
(5)内毒素血症主要是由于葛兰阴性菌侵入血流，并在血流中进行大量的繁殖，进而崩解后释放出的大量内毒素，当发生严重葛兰阴性菌感染时，往往还伴内毒素血症。
就植物而言，病毒并不局限于植物的接种部位，而是扩散感染到叶、茎、根、花等各个部分，此称为全身感染。但茎的生长点附近有时并不感染。而对于动物来说，全身感染则一般是指病原体通过血液循环等而引起的感染。
