人体的口腔其实是一个充满了各种微生物的环境，而牙菌斑往往就像是由不同细菌组成的“细菌社区”，由于这些细菌的“社区”扎根很牢固，因此在一般情况下并不能够被水冲去或者漱掉，而只能通过机械的方法对其清除。
但是，当机体内的牙菌斑量较少时，仅仅依靠肉眼是很难对其进行观察的，因此人们通常会使用菌斑指示剂进而可以很好地显示牙菌。从专业角度来讲，牙菌斑是一群由于基质包裹的互相粘附、或粘附于牙面、牙间或修复体表面的软而未矿化的细菌性群体，同时也是一类不能被水冲去或漱掉的细菌性生物膜。存在牙菌斑，主要是会对人体的牙和牙龈构成危害，最终造成口腔中最常见的两种疾病：龋病和牙周病。
龋病俗称“虫牙”，其病因主要是因为牙菌斑牢固地附着在机体的牙面上，而此时细菌能够摄入人体唾液中的糖，从而对糖进行分解最终产酸，而这些酸最终会破坏机体的牙齿使之成洞。而如果牙菌斑靠近牙龈时，那么此时细菌产生的毒素和其他有害物质则会刺激到牙龈，使之产生炎症，也就是人们常说的牙龈炎。需要注意的是，如果此时不对其加以控制，那么牙龈炎有可能会发展为不可逆的牙周炎，最终导致牙齿松动和脱落。
我们知道，口腔根本就不可能成为一个无菌的环境，因此我们也不能做到把所有的细菌都消灭。这也就意味着我们必须坚持不懈地与牙菌斑作斗争，防止最终形成牙石，因为一旦当牙石形成之后，就算使用日常口腔护理的方法也是不能将其清除掉的，只能寻求专业人士的帮助，用专门的器械清除。
其实清除牙菌斑和打扫房间类似，墙缝及各种缝隙往往是最难清洁的地方，牙齿的“缝隙”主要就是牙与牙龈之间以及牙与牙之间的缝隙，因此人们在日常进行的牙齿清洁工作中，要多注意这些地方的清洁。
