临床上的牙周袋常包含上述两种情况，即由于龈缘向冠方延伸和沟底向根方延伸而成。牙周袋是由于长期存在的慢性龈炎向深部扩展而形成的。有大量中性粒细胞浸润，会严重影响上皮细胞的营养和附着，使龈沟底移向根方而形成牙周袋。随着牙周袋加深，更有利于菌斑的堆积和滞留，使炎症更加严重，而炎症反应使牙周袋更深，于是形成牙周袋进行性破坏的恶性循环。
由于龈下微生态环境的特点，龈下菌斑中滋生着大量毒力较大的牙周致病菌，如牙龈类杆菌，中间类杆菌，螺旋体等，使牙龈的炎症加重并扩延，导致牙周袋形成和牙槽骨吸收，造成牙周炎。
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