新生儿黄疸不是遗传病，但是小部分患者的发病可能与遗传有关。有家族史的家庭成员，发生的比率比没有家族史的要高些，说明新生儿黄疸的发病与遗传有一定关系，但是无明确的对应关系。具体病因如下：
1胆红素生成过多:因过多的红细胞的破坏及肠肝循环增加，使血清未结合胆红素升高。常见的病因有：红细胞增多症、血管外溶血、同族免疫性溶血、感染、肠肝循环增加、红细胞酶缺陷、红细胞形态异常、血红蛋白病。2肝脏胆红素代谢障碍:由于肝细胞摄取和结合胆红素的功能低下，使血清未结合胆红素升高。常见的病因有：缺氧和感染、Crigler-Najjar综合征、Gilbert综合征、Lucey-Driscoll综合征、药物（如磺胺、毛花苷丙等）、先天性甲状腺功能低下。3胆汁排泄障碍：肝细胞排泄结合胆红素障碍或胆管受阻，可致高结合胆红素血症，常见的病因有：新生儿肝炎、先天性代谢性缺陷病、胆管阻塞。
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