1.诊断：
CFS的临床诊断比较困难。由于缺乏特异性实验室诊断指标，CFS的症状在其他疾病中也较为常见，许多患者表面看似健康，症状容易反复出现或消失，患者问症状的多少、类型、严重程度变化很大，几乎没有两个症状完全相同患者，所以CPS的诊断率相当低。同时，要采用排除性诊断.严格排除其他可引起类似CFS表现的～些情况。例如：
1.1.原发病能够解释的慢性疲劳。例如，未治疗的甲状腺功能减遇症、失眠、贫血、自身免疫性疾病、药物副作用所致医源性疲劳等。
1.2.临床诊断明确，现有医学条件下治疗困难的一些疾病持续存在引起的慢性疲劳。如乙型肝炎病毒或丙型肝炎病毒感染患者。
1.3.过去或现在主要诊断为精神抑郁性情绪失调或具有忧郁性特征的消极情绪失调、各类精神分裂症、各类妄想症、各类痴呆、神经性屣食或神经性贪食。
1.4.病前两年至今有各种不良嗜好、嗜烟、酗酒等。
1.5.严重肥胖，身材指数=体重(kg)/身高(m)>45。
1.6.目前国内外应用量多的是1994年美国疾病控制中心修订的CFS慢性疲劳综合征诊断标准。主要内容如下：
1.6.1..具有临床评定的不能解释的新发的持续或反复发作的疲劳，不是由正在从事的劳动引起，休息后也不能缓解，症状持续6个月以上，并有职业、受教育、活动等能力的明显下降。
1.6.2.具备下列8项指标中的4项以上异常。并持续6个月以上。
记忆力或集中注意力能力下降;
活动(包括体力和脑力活动)后极易疲劳，且持续时间长;
睡眠后精力不能恢复;
肌肉疼痛;
多关节疼痛，不伴关节红肿;
疼痛性质和程度较前不同的头痛;
频繁或反复发作的咽痛;
颈部或腋下淋巴结肿大。
需注意上述诊断标准中所指的是临床症状而非体征，当有阳性体征时需注意查找原因，以免误诊。
2.鉴别诊断：
由于本病病因和发病机制尚不明确及诊断标准多以主观症状为主.因而鉴别诊断比较困难，多采用排除法。
CFS需要与诸如恶性疾病.自身免疫性疾病.感染，内分泌疾病，毒品依赖症，慢性肺疾病，以及心脏、胃肠、肝、肾和血液疾病等引起的慢性疲劳相鉴别，下述临床特点有助于区别CFS患者与一般疲劳：
2.1.疲劳程度多较严重，病程几个月以上，休息不能缓解;
2.2.流感样症状，为低热(37.5～38.6℃)、肌痛、关节痛(非关节炎)、每周数次咽部刺痛和发痒、颈部或腋窝淋巴结肿大及触痛、头部重压感.起病突然;
2.3.特有的神经精神症状.如记忆丧失、定向障碍、说话困难、注意力不集中、理解能力差.同时伴有睡眠障碍，感觉非常衰竭乃至不能入睡(约20%的患者完全不能入睡)。但美国NIH提出一些经过治疗的结缔组织疾病患者仍有持续性慢性疲劳综合征的症状与体征，也可列为慢性疲劳综合征的一组。
CFS的抑郁表现与原发性抑郁症在性质上有所不同。经心理学测验表明，前者有急性精神痴呆表现。最重要的鉴别要点是CFS患者能积极治疗，可以恢复活力.对未来充满希望;后者则表现为孤独、绝望、无能，可能出现反复的自杀倾向。当无法鉴别时.可请有临床经验的精神科医生协助诊断。
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