1.检查：
1.1.细菌学检验：不同的菌株或核糖分型有不同的致病力，核糖分型对囊性纤维化患者进行肺移植术前评价其感染的相对危险性是有用的。
根据病情需要，可采取痰液、支气管肺泡灌洗液、胸腔脓液、血液、腹水、尿等标本。
洋葱假单胞菌分型方法有：质粒分析，通过脉冲场凝胶电泳(PFGE)比较DNA指纹类型核糖分型，细菌素分型，血清分型，生化试验，结合表型分析通过PFGE获得DNA指纹，线粒体DNA限制性酶切片段类型分析，细胞外产物类型分析等。有研究发现洋葱假单胞菌分离菌株的表现型多变，在一定时间内从一个病人身上分离到的细菌菌落外观、抗生素敏感性、色素产物均不一样。核糖分型可区分一个菌落衍生的所有分离菌。表现型的多样性可能为不同基因表达的结果。
1.2.外周血白细胞增高，血沉加快，C-反应蛋白增多。
1.3.X线表现：肺实质浸润常为肺叶性，偶有广泛性改变，可有空洞形成。肺功能FEV1、FEV1/FVC进行性下降。
2.诊断：在免疫功能严重受损和(或)囊性纤维化病人，反复或持续高热，进行性体重减轻，肺功能急剧下降，胸部X线表现为肺实质浸润，痰培养连续2次以上阳性(培养基上仅有或主要为洋葱假单胞菌)，即可诊断为洋葱假单胞菌肺炎。支气管肺泡灌洗液培养阳性亦有助于诊断。
3.鉴别：该病主要与铜绿假单胞菌肺炎鉴别，主要依靠痰培养结果。有时为两种细菌合并感染。铜绿假单胞菌肺炎合并菌血症罕见。
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