食物过敏和不耐受常见于婴儿期，尤其是在有特应性疾病(如过敏性鼻炎或过敏性哮喘)家族史的婴儿。最初表现可能是湿疹。湿疹可伴有或不伴有恶心、呕吐、腹泻等消化道症状，这可能是也可能不是由食物过敏引起，到1岁时湿疹可能已不是主要问题。有食物过敏的儿童，随着年龄的增长，有可能发生其他特应性疾病，包括过敏性哮喘和季节性过敏性鼻炎。然而，成人和10岁以上儿童，即使皮试呈阳性，食物过敏与呼吸道症状关系不大。
有些人对食物中的特殊变应原，特别是坚果、豆类、种籽和贝类，可出现严重过敏性反应。对这些食物过敏的人即使食用很少量也可发生极强的反应，表现为全身性皮疹、喉头水肿和阻塞以及呼吸困难。血压突然下降，导致晕厥和虚脱。这种威胁生命的急症称为过敏症。有的人只在进食这类食物后立即运动才会出现过敏反应。
食物添加剂也可引起食物过敏或不耐受的症状。某些食物含有毒素或化学物质(如组胺)，它们可引起非过敏性的不良反应，如谷氨酸钠(MSG)也不引起过敏反应。有报道对硫酸盐(如作为食物防腐剂的焦亚硫酸盐)和染料(如酒石黄，一种黄染料，可用于糖果、软饮料和商用制备食品)敏感的人，接触这类物质后可引起哮喘和荨麻疹。还有些人进食某些食物后可引起偏头痛。
食物过敏和不耐受的症状通常是十分清楚的，但要将二者严格区分并不容易。有些成年人对很多经口摄入的变应原，通过消化可防止过敏反应。例如，面包师哮喘是因面包师工作时吸入面粉或其他谷物粉尘引起，但他进食这些食物并不出现过敏反应。
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