自身抗体指的是指针对自身组织，器官、细胞及细胞成分的抗体。由于人体的生长、发育和生存都有完整的自身免疫耐受机制的维持，免疫系统的正常与否决定这人体是否会产生疾病。自身抗体在人体血液中有一定的滴度，若自身抗体的滴度超过—定的水平，就会对身体产生损伤，从而诱发疾病。在人体自身耐受的完整性遭到破坏时，则会产生自身免疫反应，从而机体会产生自身抗体。
自身免疫性疾病中有许多自身抗体，例如抗心磷脂抗体、中性粒细胞胞浆抗体、抗线粒体抗体、抗红细胞抗体、抗血小板抗体、抗内皮细胞抗体、抗神经原抗体、类风湿因子、抗甲状腺球蛋白抗体、抗胰岛素体抗体等等，其中最重要的是抗核抗体。抗体一般是由于外来蛋白质或其他物质进入机体后由免疫系统产生，它是用于免疫反应从而消灭外来的有害物质。免疫系统在一般情况下能够识别并忽视机体自身的细胞，所以不对其产生抗体，而且我免疫系统也不会对环境中没有威胁的物质，产生反应。但是，在某些特定情况下，免疫系统的识别功能会失效，会把自身的物质当做是抗原，从而机体会产生自身抗体，引发自身免疫反应。这种免疫识别功能的失效会是机体免疫系统混乱，自身抗体会攻击机体自身的细胞、组织、器官，引起炎症反应，对机体造成损害。
自身抗体的发病机制至今没有弄清楚，可能是致病抗原与自身成分之间存在某些相同的分子结构：出现了与自身抗原发生交叉反应的免疫应答;也可能是某些感染因素使自身抗原变性，免疫系统对这些暴露的新抗原产生自身抗体。
